Молекулярная филогенетика применяет сочетание молекулярных и статистических методов для установления эволюционных связей между живыми существами или генами. Основной целью молекулярно-филогенетических исследований является восстановление порядка трансформационных событий и представление их в деревьях развития, которые графически иллюстрируют связи между видами или генами через некоторое время. Стратегии, используемые в классических исследованиях, одинаковы как для молекулярных, так и для морфологических признаков, молекулярные данные дают несколько интересных моментов. Начнем с того, что молекулярная информация предлагает обширное и практически безграничное расположение символов. Теоретически каждую позицию нуклеотида можно рассматривать как символ и считать свободной. ДНК любого существа имеет от миллионов до миллиардов нуклеотидных позиций. Более того, из-за огромных размеров генома маловероятно, что естественный отбор будет сильно стимулировать изменения в каком-либо конкретном нуклеотиде. Скорее, большинство нуклеотидных изменений «незаметны» в результате естественного отбора и подвержены лишь мутациям и случайному генетическому дрейфу.
Журнал по молекулярной филогенетике
Журнал филогенетики и эволюционной биологии, Международный журнал роевого интеллекта и эволюционных вычислений, Журнал протеомики и биоинформатики, Журнал прикладной биоинформатики и вычислительной биологии, Новейшая молекулярная филогенетика и эволюция, Молекулярная филогенетика и эволюция, Журнал филогенетики и эволюционной биологии, Молекулярная систематика и филогенетика, Систематика и филогения членистоногих.